时间: 2023-08-08 21:20:39 | 作者: 品牌介绍
拟南芥因其植株小、易繁衍、生长期短等特性，为遗传研讨供给了极大的便当，因而拟南芥一向是植物学研讨范畴一种最为抱负的样本物种，被科学家称为“植物中的果蝇”。
现在全国际有近万家实验室正在对拟南芥进行遗传剖析、基因克隆和功用基因组等科学研讨。但是，完好拼装拟南芥基因组，尤其是完结着丝粒和端粒序列的拼装是当今科学界亟待破解的难题。这些序列存在很多高度重复的片段，给基因组拼装带来了巨大困难，阻止了科学家对该区域序列及其功用的研讨。
近来，西安交通大学自动化学院教授叶凯和计算机学院副教授杨晓飞为一起通讯作者在《基因组蛋白质组与生物信息学报》宣布研讨，他们根据在罂粟及人类基因组拼装所堆集的经历，规划了综合利用不同测序技术优势的混合测序战略，提出细菌人工染色体为锚点的序列替换新战略，完成了仅剩两个缺口的高质量拟南芥基因组Col-XJTU。并且该基因组完结了三号、四号及五号染色体着丝粒的无缺口拼装，并完结了一号和二号染色体大部分着丝粒的拼装。此外，该基因组的碱基准确性和结构准确性均高于现在的参阅基因组TAIR10.1碱基精度为99.9999%。
“20多年来国际上植物研讨范畴中拟南芥参阅基因组的规范一向由欧美国家界说，咱们团队研讨完成的拟南芥基因组质量是现在国际上的最高规范。”西安交通大学信息与生物医学穿插团队首席科学家叶凯讲，“该基因组以哥伦比亚生态型和西安交通大学英文缩写命名，凸显了西安交大科研团队在拟南芥基因研讨中的重要贡献，也为国际植物基因组学研讨供给了我国才智。”
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