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碱基精度9999% 高质量拟南芥基因组完结拼装

时间: 2023-08-08 21:20:31 |   作者: 品牌介绍

  科技日报讯 (记者史俊斌 通讯员刘昱晗)记者9月13日从西安交通大学得悉,该校电信学部自动化学院教授叶凯、计算机学院副教授杨晓飞带领的研讨团队完好拼装出拟南芥基因组,完结了仅剩两个缺口、碱基精度为99.9999%的高质量拟南芥基因组Col-XJTU,高于现在的参阅基因组。相关研讨效果近来在国际期刊《基因组、蛋白质组与生物信息学报》上宣布。

  破译生命遗传暗码的故事要从20世纪鼓起的“人类基因组方案”讲起,它与曼哈顿方案、阿波罗登月方案并称为天然科学史上的“三大方案”。该方案在研讨人类进程中建立起来的战略、思维与技能,构成了生命科学范畴新的学科——基因组学,以研讨微生物、植物及其它动物。

  拟南芥的研讨归于植物基因组研讨范畴,拟南芥因其植株小、易繁衍、生长期短等特性,为遗传研讨供给了极大的便当,在植物研讨范畴被誉为“植物中的果蝇”,被科学家选为形式植物。现在,全国际有一半的植物学家、近万家实验室正在对拟南芥进行遗传剖析、基因克隆和功用基因组等研讨,获得的研讨打破为粮食增产、农作物抗逆、植物保护等作出了重要贡献。

  西安交通大学信息与生物医学穿插团队以人工智能算法开发、生物医学大数据发掘为手法,规划了归纳利用不同测序技能优势的混合测序技能,提出以细菌人工染色体为锚点的序列替换新战略,完结了仅剩两个缺口的高质量拟南芥基因组Col-XJTU。研讨团队成员王博指出,拟南芥共有5条染色体,Col-XJTU基因组完结了三号、四号及五号染色体着丝粒的无缺口拼装,并完结了一号和二号染色体大部分着丝粒的拼装。

  基因组的碱基准确性和结构准确性是评价参阅基因组质量的目标。西安交通大学信息与生物医学穿插团队首席科学家叶凯告知记者,Col-XJTU基因组以哥伦比亚生态型和西安交通大学英文缩写命名,凸显了西安交通大学科研团队在拟南芥基因研讨和国际植物基因组学研讨中的重要贡献。

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  古人依托化学办法加工、改造物质,一起发明了各种关于物质实质和改变规则的学说。

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  现在,我国正建议并牵头多个空间望远镜项目,必将为未来的空间观测使命拓荒新的前沿,推进咱们对世界的知道。

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